
Other
06 \ 其它
菌类
一、蛋白组学
- 1. TMT
- 1.1. 3000g - 5000g 离心 5 - 15min,去上清;
- 1.2. PBS 洗涤沉淀三次,后转移到冻存管中(50mg-2g/sample);
- 1.3. 液氮速冻后菌体-80℃保存。
- 2. Label free
- 2.1. 3000g - 5000g 离心 5 - 15min,去上清;
- 2.2. PBS 洗涤沉淀三次,后转移到冻存管中(25mg-1g/sample);
- 2.3. 液氮速冻后菌体-80℃保存。
- 3. 磷酸化蛋白组学
- 3.1. 3000g - 5000g 离心 5 - 15min,去上清;
- 3.2. PBS 洗涤沉淀三次,后转移到冻存管中(100mg-4g/sample);
- 3.3. 液氮速冻后菌体-80℃保存。
- 3. 糖基化蛋白组学
- 3.1. 3000g - 5000g 离心 5 - 15min,去上清;
- 3.2. PBS 洗涤沉淀三次,后转移到冻存管中(259mg-10g/sample);
- 3.3. 液氮速冻后菌体-80℃保存。
二、代谢组学
- 1. 菌体
- 1.1. 取混匀后的细菌培养液一定体积(1*107 菌体/sample);
- 1.2. 4℃,1000g离心 10min,弃上清留沉淀(低速离心的目的是再保证菌体不破碎的 前提下将菌体沉淀下来,可以根据实验室具体情况调整离心力大小不时长,下同);
- 1.3. 淬灭:将盛有菌体沉淀的离心管浸泡在液氮中 ≥ 10min;
- 1.4. 漂洗:将淬灭好的菌体在冰上解冻,然后用PBS进行漂洗(1000g,4℃,离心) 一次;
- 1.5. 去除上清,-80℃冰箱保存。
- 2. 培养液
- 2.1. 进行菌体计数,计算出 1*107 个菌体所需要的体积(该体积为 1 体积,也就是说 1 体积菌体悬浮液中含有 1*107 个菌体);
- 2.2. 将菌体培养液手摇轻轻混匀后,取1体积菌体悬浮液,4℃,1000g,离心1min(沉 淀菌体,离心力不宜过大,防止菌体破碎,可以根据实际情况调整);
- 2.3. 取上清 500μL 至 1.5mL 离心管中(最少不低于 100μL/sample);
- 2.4. 然后放到液氮中浸泡 ≥ 10min 速冻;
- 2.5. 放入-80℃冰箱保存。