Cells

02 \ 细胞收集指南

蛋白组


一、RNA pulldown-质谱/WB
提供4E7细胞
收样标准(贴壁细胞)
1) 弃掉培养液,并将培养皿倒置于吸水纸上吸干培养液
2) 加入4℃预冷的PBS,平放轻轻摇动1分钟洗涤细胞,然后弃去PBS。 重复以上操作两次以洗去培养液。
3) 将培养皿置于冰上。向培养皿内加入4℃预冷的PBS。用干净的细胞刮棒将细胞刮于培养皿的一侧(动作要快),冰上斜置培养皿,使得缓冲液流向一侧。移液管吸取溶解产物至预冷的离心管内。1000g,10分钟离心,去掉上清。
4) 液氮速冻,-80℃保存,干冰送样
收样标准(悬浮细胞)
1) 1000g离心10分钟收获细胞,弃上清。
2) 用预冷的PBS小心洗涤片状沉淀物2次,置于冰上,去上清。
3) 液氮速冻,-80℃保存,干冰寄送
二、TMT
悬浮细胞:5-10×10^6
1. 400g-1000g 离心10 分钟收获细胞,弃上清。
2. 用预冷的PBS 小心洗涤片状沉淀物2 次,置于冰上,去上清。
3. 液氮速冻,-80℃保存。
强烈建议客户本地裂解细胞,具体方法:参见上述步骤将细胞用PBS 洗涤之后,弃净PBS,根据后续不同的实验方法要求加入相应裂解液重悬片状沉淀物,使得每ml 内含有5 × 10^7 细胞,-80℃保存。
贴壁细胞:5-10×10^6
1. 弃掉培养液,并将培养皿倒置于吸水纸上吸干培养液
2. 加入4℃预冷的PBS,平放轻轻摇动1 分钟洗涤细胞,然后弃去PBS。 重复以上操作两次以洗去培养液。
3. 将培养皿置于冰上。向培养皿内加入4℃预冷的PBS。用干净的细胞刮棒将细胞刮于培养皿的一侧(动作要快),冰上斜置培养皿,使得缓冲液流向一侧。移液管吸取溶解产物至预冷的离心管内。离心去上清。
4. 液氮速冻,-80℃保存。
强烈建议客户本地裂解细胞,具体方法:参见上述步
三、Shotgun
处理方法同TMT,所需量为TMT的1/2
四、labelfree
处理方法同TMT,所需量为TMT的1/2
五、PRM
处理方法同TMT,所需量为TMT的1/2
六、DIA
处理方法同TMT,所需量为TMT的1/2
七、磷酸化TMT
处理方法同TMT,所需量为TMT的2倍
八、N-糖基化label free
处理方法同TMT,所需量为TMT的2倍
九、乙酰化label free
处理方法同TMT,所需量为TMT的10倍
十、泛素化label free
处理方法同TMT,所需量为TMT的10倍