针对基因的功能研究，通常会遇到两种情况的问题：

一种情况是一个基因一个基因的进行，效率低，往往要做好几个基因才能找到功能明显和确定的基因。

另一种情况是做完高通量组学比如表达谱芯片、RNA-seq、全基因组测序、全外显子测序、蛋白质组学等，有成百上千个候选基因、蛋白、突变位点等，不知道该挑选什么基因进行下面的研究。

HCS就是为了解决基因功能研究中这两种最常见的困难而诞生的。

HCS（High content Screening）高内涵筛选，指一次性对至少20个甚至更多的编码基因或非编码RNA进行基因干扰、敲除或者过表达等基因操作；还可以一次性对大量的突变位点/SNP位点进行过表达，然后在细胞层面进行功能表型检测，筛选有明显功能的基因或者突变位点。可以大幅度缩短寻找新功能基因的科研时间，提高科研效率和节约科研成本。

1. 全球领先的基因操作慢病毒文库资源

shRNA-SET^TM慢病毒shRNA文库

90000个RNA干扰慢病毒克隆，覆盖超过22000个人类基因

cDNA--SET^TM全长基因克隆文库

覆盖超过20000个人类基因的ORF克隆

各种细胞模型（300多株）

种类齐全的病毒工具（慢病毒、腺病毒、AAV）

2. 超过10年的应用经验，实验人员技术熟练、经验丰富

3. 多种高内涵筛选仪器平台

ThermoFisher Cellomics、Brooks Automation Celigo、YOKOGAWA CQ1

4. 高检出率

5.重复性好

增殖功能基因筛选

调控不同基因的慢病毒感染目的细胞后，通过高内涵仪器连续多天快速扫板，拍摄调控不同基因以后细胞的增殖情况，通过增殖曲线可以准备的判断哪些基因knock-down或overexpression以后能够导致细胞增殖能力的变化，筛选增殖相关的功能基因。

转移相关功能基因筛选（划痕法）

转移相关功能基因筛选（transwell法）

调控不同基因的慢病毒感染目的细胞后，根据感染后的细胞在一定时间内穿过transwell小室的细胞量，对细胞一定时间内的迁移率进行统计，通过shCtrl与各实验组迁移率比较后进行统计，筛选转移相关功能基因。

明星基因功能回复panel

寻找目的基因或者是处理因素（如：药物）相关的功能回复基因（目的基因或者是处理因素必须是抑制细胞增殖或者转移的）。

在目的细胞中用shRNA包装成慢病毒干扰目的基因，然后在目的基因干扰的情况下，感染下游明星通路基因的调控慢病毒，检测细胞的增殖或者转移情况，寻找跟目的基因有功能回复关系的明星通路基因。

药靶基因筛选

调控不同基因的慢病毒感染目的细胞后，通过高内涵仪器连续多天快速扫板，拍摄调控不同基因以后细胞对药物的敏感情况，通过计算不同基因操作以后，药物对细胞的抑制率，初步筛选和药物相关的目标基因。

血管新生功能基因筛选

调控不同基因的慢病毒感染肿瘤细胞一定时间后，将细胞上清转移至人脐静脉内皮细胞系培养孔中，通过HCS快速扫板，拍摄人脐静脉内皮细胞的成管情况，可以快速的检测上调，下调或者敲除不同基因的情况下，血管新生能力的变化，从而筛选到血管新生功能相关的功能基因。

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3. Integration of high-content screening and untargeted metabolomics for comprehensive functional annotation of natural product libraries ;PNAS,September 29, 2015; VOL112; No. 39,11999–12004.

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