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WGCNA分析

WGCNA全称 Weighted Correlation Network Analysis,中文翻译为加权基因共表达网络分析。它是一种分析多个样本基因表达模式的方法,可将表达模式相似的基因进行聚类形成不同的模块,然后分析模块和表型的关联,以此达到鉴定目标的靶点基因、寻找网络的核心基因。

RRBS分析demo报告解读

RRBS(Reduced representation bisulfite sequencing) 即简并代表性亚硫酸氢盐测序技术。是一种用于基因组单核苷酸级别的甲基化水平分析的高效的高通量测序技术。

WGBS分析demo报告解读

WGBS(Whole genome bisulfite sequencing)WGBS可以单碱基分辨率尺度下在全基因组范围内鉴定和定量甲基化状态

全外显子测序WES报告解读

全外显子测序 (Whole-exome sequencing,WES)是应用频率最高的基因组测序方法。外显子是人基因组的蛋白编码区域,利用序列捕获技术可以将其DNA捕获并且富集。

circRNA-seq报告解读

环状RNA(circRNA)是一类特殊的非编码RNA分子,也是RNA领域最新的研究热点。与传统的线性RNA(linear RNA,含5’和3’末端)不同,circRNA分子呈封闭环状结构,不受RNA外切酶影响,表达更稳定,不易降解。

RNA-seq报告解读

RNA-seq即转录组测序技术,就是把mRNA用高通量测序技术进行测序分析,反映出它们的表达水平。

miRNA-seq报告解读

microRNA是一类存在于真核生物中的,长度为~22nt的单链小分子RNA。miRNA通过与靶mRNA的结合,促使mRNA降解或是阻碍其翻译,从而抑制靶基因的表达。

LncRNA-seq报告解读

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类转录本长度超过200nt、不编码蛋白的RNA。

全基因组测序WGS报告解读

WGS全称为whole-genome shotgun就是bai全基因组du鸟枪法,提取基因组DNA,然后随机打断,电泳回收所需长度的DNA片段(0.2~5Kb),加上接头, 进行DNA簇(Cluster)制备,最后利用Paired-End(Solexa)或者Mate-Pair(SOLiD)的方法对插入片段进行测序。

meRIP-seq报告解读

甲基化RNA免疫共沉淀 (methylated rna immunoprecipitation,merip)基于抗体特异性结合甲基化修饰的碱基的原理,以RNA免疫共沉淀富集甲基化修饰片段为基础,然后通过高通量测序,在全转录组范围内研究发生甲基化的RNA区域,高效获得结果。