GFP慢病毒感染细胞后，细胞中荧光强度取决于病毒进入到细胞的颗粒数、细胞本身的增殖状态、细胞类型、观察时间、GFP基因前面的启动子活性等因素。

通常目的细胞感染慢病毒颗粒数越多，细胞本身增殖越快，GFP荧光会较强。慢病毒在增殖较快的细胞中感染96~120小时后，GFP蛋白表达才达到峰值；在增殖较慢的细胞中感染后，GFP蛋白表达达到峰值需要更长的时间。GFP基因接在强启动子后面时荧光表达强；GFP接在弱启动子后面时荧光表达较弱。