转录组测序所需的测序量随研究目的的不同而有所差异。目前，为保证数据分析结果的可靠性和准确性，吉凯基因推荐对有参考基因组的转录组采用最低6Gb clean data进行后续分析，如果想检测到低丰度的转录本推荐采用10Gb clean data。如果没有参考基因组，需要进行转录本的拼接组装，为了拼接组装的完整性，吉凯基因推荐最低10Gb clean data的转录组测序。