有些老师比较了解蛋白组学定量蛋白质组的流程，因此，有此问题。早期的商业服务公司，往往会将不同客户的样本放到一起，如此可以有效的节约成本。但是，我们坚决不会将不同客户的样本混合到一起上质谱。如果客户的样品来自不同物种，那么质谱鉴定的数据库选择会不同，无法进行比较。如果是同一个物种的样品，那么经过不同实验室处理后，样品里的蛋白含量和数目会有较大差别，混在一起后会影响两组不同来源的样品的蛋白鉴定数目。甚至于来源于同一组织的不同细胞系一般也不推荐放在一起上机，因为不同细胞系的蛋白质组差异较大，放在一起上机会影响后续定量。当然单纯从实验技术角度考虑是可以做的，但是后续数据可靠性无法保证，因此这种情况售前一定要沟通清楚。