• 样本收集与储存注意点有哪些?

    1.快:尽快洗净或处理,处理后尽快冷冻。细胞可以直接用Trizol裂解后冷冻,组织洗净后、分小块后直接冷冻。(RNA Later®有帮助,注意组织要薄或小)

    2.低温:先浸入液氮,数小时后再放入-70或-80度超低温冰箱更佳。超低温冰箱可以保存数月至一年,-20度不宜久存

    3.避免温度波动:一台经常开关门,温度上下波动的-80度冰箱,可能还不如一台稳定在-40度的冰箱。

    4.其他:推荐进口冻存管,标签冷冻后容易破碎,不如自己记号笔标记。

  • 芯片的重复数?

    常规建议:

    1.均一的样本:如细胞系,处理vs不处理,各3~4/组

    2.较均一的样本:如成系的动物,处理vs不处理,各5~8/组

    3.不均一的成对样本:如多例病人,同一人的癌和癌旁,~20/组

    4.不均一的不成对样本:如多例病人组织vs正常人组织。~40/组

  • 芯片和其他技术的区别?

    mRNA水平研究方法

    高/低通量

    一次实验检测基因数

    Northern-blot、RT-PCR等

    低通量

    一个基因

    功能分类PCR芯片

    相对高通量

    84或370个基因

    全基因组表达谱芯片

    高通量

    几万个基因

    mRNA高通量测序

    高通量

    几万个基因

  • 芯片样本的取材?

    组织:根据实验目的选择最合适的组织mRNA丰富、完整,最能代表难获取

    注意:待研组织的占比

    细胞:培养或分离的细胞处理简单,代表性略弱

    血液、体液:血液、体液中游离的mRNA极少--不够量,易降解—不完整,不具有代表性

    分离细胞——注意量

    一般需要5E+6~5E+7 cells,或0.5*0.5*0.5 cm组织;0.5 ~2μg总RNA

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