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circRNA 测序

circRNA 是一类区别于传统线性RNA的非编码RNA分子,呈闭合环状结构,对RNase R不敏感,比线性RNA更加稳定。circRNA具有进化保守性,表达具有组织和时空特异性。circRNA 功能众多,可作为 miRNA 的海绵,竞争性结合miRNA,发挥 ceRNA的调控功能,调控基因表达,并与疾病的发生和发展密切相关。近年来还发现,在疾病诊断标记物等方向具有很大的应用前景。

技术优势

平台优,周期短,性价比高。
基于高通量测序,依据主流数据库和circRNA鉴定软件,分析物种的circRNA信息,深入挖掘circRNA在转录调控中
所发挥的重要功能。

技术路线

技术参数

样本要求

样本类型 样品量需求 无降解RNA
组织 ≥1g 总量≥10μg,浓度≥150ng/μl
OD160/280=1.8-2.2
RIN≥6.5,28S/18S≥1.0
细胞 ≥4×107
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检测平台

Hiseq PE150        NovaSeq6000 PE150




常规项目周期

35个工作日

参考文献

Yu CY, Li TC, Wu YY, et al. 2017. The circular RNA circBIRC6 participates in the molecular circuitry controlling human pluripotency. Nature Communications,2017, 8:1149.