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RNA水平研究

N-糖基化label free

糖基化是指蛋白质在酶的作用下被连接上糖链的修饰类型。细胞内超过50% 的蛋白质都修饰有糖链。N-糖基化是指糖链连接于天冬酰胺(Asn)残基上的糖基化形式,参与细胞识别、免疫应答、细胞分化等生命活动。N-糖基化label free技术是利用凝集素将糖基化肽段富集出来后再切除糖链后联合label free技术进行糖肽位点以及定量分析。

技术流程

 N-糖基化label free技术流程图

技术原理

1. 蛋白质经酶解后利用凝集素富集N-糖基化肽段,再用N-糖酰胺酶F(PNGase F)在H218 O中切除糖链,使得糖基化修饰过的位点引入18 O,分子量的增加使得在液质联用系统中能够轻松辨别出该位点,从而确定N-糖基化发生的位点;

2. 定量原理同label free,具体请见Label free界面。

吉凯基因实验流程

吉凯基因优势

1. 软硬件先进(仪器为QE和QE PLUS,软件为MaxQuant);

2. 质控严格(预实验中每个样本都需要进行蛋白质级别和预质谱级别的质检,不合格的给予合理建议。同时对仪器条件进行严格监控,发现不合格则重新开展实验,确保实验数据有效);

3. 专业的团队(团队成员经验丰富,能处理几乎所有类型的样本分析);

4. 强大的生信分析团队(除GO,KEGG等常规的分析外,还能进行IPA,趋势聚类,蛋白质相互作用以及其他个性化分析)。

吉凯基因成功案例

参考文献

Campbell J D, Alexandrov A, Kim J, et al. Distinct patterns of somatic genome alterations in lung adeno-carcinomas and squamous cell carcinomas[J]. Nature Genetics, 2016, 48(6):607.

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