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RNA水平研究

泛素化label free

泛素化是一种广泛存在的翻译后修饰(PTMs)。泛素化是指泛素(一类低分子量的蛋白质)分子在一系列特殊的酶作用下,将细胞内的蛋白质分类,从中选出靶蛋白分子,并对靶蛋白进行特异性修饰的过程,与蛋白质降解和功能调控密切相关的翻译后修饰形式。泛素化在蛋白质的定位、代谢、功能、调节和降解中都起着十分重要的作用,同时它也参与了细胞周期增殖凋亡分化转移基因表达转录调节、信号传递、损伤修复、炎症免疫等几乎一切生命活动的调控,与肿瘤、心血管等疾病的发病密切相关。

带有泛素化修饰的肽段比例很低,其他大量存在的肽段会影响泛素化肽段质谱信号的鉴定,因此在质谱检测前需要对泛素化肽段进行富集。Trypsin酶切后的泛素化修饰是一个较小的Motif(K-GG),采用具有高亲和力的基序抗体,能够特异性富集复杂样本中的泛素化肽段,结合label free蛋白质定量方法,实现大规模泛素化蛋白质定性定量分析。

技术流程


吉凯基因优势

1. 软硬件先进(仪器为QE,QE PLUS, HF X,软件为MaxQuant);

2. 采用CST泛素化肽段富集试剂盒,确保富集效果稳定有效;

3. 质控严格(预实验中每个样本都需要进行蛋白质级别和预质谱级别的质检,不合格的给予合理建议。同时对仪器条件进行严格监控,发现不合格则重新开展实验,确保实验数据有效);

4. 专业的团队(团队成员经验丰富,能处理几乎所有类型的样本分析);

5. 强大的生信分析团队(除GO,KEGG等常规的分析外,还能进行IPA、趋势聚类、蛋白质相互作用以及其他个性化分析)。

参考文献

Wagner SA, Beli P, Weinert BT, Schölz C, Kelstrup CD, Young C, Nielsen ML, Olsen JV, Brakebusch C, Choudhary C, Proteomic analyses reveal divergent ubiquitylation site patterns in murine tissues, Mol Cell Proteomics. 2012 Dec;11(12):1578-85.

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