RNA水平研究

代谢组学(脂类分子)

脂质是自然界中存在的一大类极易溶解于有机溶剂,在化学成分及结构上非均一的化合物,主要包括脂肪酸及其天然发生的衍生物(如酯或胺),以及与其生物合成和功能相关的化合物。脂质主要分为八大类:脂肪酸类(fatty acids)、甘油脂类(glycerolipids)、甘油磷脂类(glycerophospholipids)、鞘脂类(sphingolipids)、固醇脂类(sterol lipids)、孕烯醇酮脂类(prenol lipids)、糖脂类(saccharolipids)、多聚乙烯类(polyketides)。
脂质组学(lipidomics)是对生物体、组织或细胞中的脂质以及与其相互作用的分子进行全面系统的分析、鉴定,了解脂质的结构和功能,进而揭示脂质代谢与细胞、器官乃至机体的生理、病理过程之间的关系的一门学科。目前脂质组学已经被广泛运用于药物研发、分子生理学、分子病理学、功能基因组学、营养学以及环境与健康等重要领域。

技术优势

定性定量准:采集客户样本物质二级图谱与自建标准数据库二级谱逐一智能匹配,物质鉴定准确性高;
检测种类多:自主构建脂质代谢物的数据库,包含34类,76361种脂类物质 ,181300张MS/MS二级质谱图;
样本前处理经验丰富:可处理各种组织细胞样本;
专业的数据分析:专业的数据处理和分析软件,能对数据进行PCA、OPLS-DA、T-test、等分析。 

技术路线


技术参数

样本要求




生物学重复


样本数量:植物和微生物≥6,动物样本n≥10,临床样本n≥30,所有重复样本独立分析。其他种类的样品在收集之前请联系公司销售工程师。




检测平台

AB Triple TOF 6600(Agilent 1290 UHPLC-AB 6600 MS)




常规项目周期
实验检测:45个工作日(从收到客户预付款并收到样品之日起)
数据分析:10个工作日

应用方向

1. 组织细胞中脂质物质鉴定
2. 脂质功能及代谢调控研究
3. 脂质代谢途径及网络研究
4. 脂质生物标志物发掘

案例分析

脂质组学和转录组学研究棉蚜虫脂质变化机理

棉蚜虫 (Aphis gossypii Glover)是一种重要的农业害虫,是我国棉花主要害虫之一。它通过寄生吸食汁液,能够在早期生长季节对棉花幼苗造成严重损害。据报道拟寄生物对蚜虫的脂质合成有影响,然而目前尚不清楚这些脂质变化如何影响棉蚜虫生理过程。本研究首次基于RNA-Seq与脂质组学联合分析方法,探讨了拟寄生物对棉蚜虫脂代谢及基因表达的影响。结果表明寄生导致脂质代谢的显著变化及甘油酯和甘油磷脂的组成变化。这些数据可作为研究寄生虫-昆虫相互作用的宝贵资源,并将进一步表征脂质合成途径及其与三羧酸(TCA)循环和糖酵解的关系。


参考文献

Gao X K, Zhang S, Luo J Y, et al. Lipidomics and RNA-Seq Study of Lipid Regulation in Aphis gossypii parasitized by Lysiphlebia japonica[J]. Scientific Reports, 2017, 7(1):1364.

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