RNA水平研究

DIA

DIA(Data independent acquisition)技术是新一代蛋白质组学分析技术,由蛋白质组学届巨擘Ruedi Aebersold教授开创,是基于质谱的生物样本数字化技术,被Nature Methods杂志评为2015年最值得关注的技术。

技术简介

与传统的DDA数据采集需要依赖一级质谱信号不同,DIA数据采集过程中不依赖一级信号,而是将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口,高速、循环地对每个窗口中的所有离子进行选择、碎裂、检测,从而无遗漏、无差异地获得样本中所有离子的全部碎片信息。从而实现对样本中蛋白质组的相对定量。这样的技术流程融合了传统蛋白质组学“鸟枪法”(shotgun)和质谱绝对定量“金标准”选择反应监测/多反应监测(SRM/MRM)技术的优势和特点。





与传统的DDA采集模式相比,DIA技术在检测结果上具有以下优势:

1、数据采集更完整




2、DIA定量更稳定




3、DIA更能检测到低丰度信号

DIA技术流程

吉凯基因DIA技术优势


1、先进的分析仪器-----HF X





2、最专业的分析软件-----Spectronaut Pulsar





3、最严格的质量控-----iRT保留时间校正




4、最专业的实验团队(深耕蛋白质组学多年,由多名博士及相关专业技术人员组成,能处理各种不同类型样本)




5、强大的生信分析能力(除GO,KEGG等常规的分析外,还能进行IPA,趋势聚类,蛋白质相互作用以及其他个性化分析)

参考文献

1.Herrington D M, Mao C, Parker S J, et al. Proteomic architecture of human coronary and aortic atherosclerosis[J]. Circulation, 2018, 137(25): 2741-2756.

2.Liu Y, Buil A, Collins B C, et al. Quantitative variability of 342 plasma proteins in a human twin population[J]. Molecular systems biology, 2015, 11(2): 786.

3.Liu Y, Borel C, Li L, et al. Systematic proteome and proteostasis profiling in human Trisomy 21 fibroblast cells[J]. Nature communications, 2017, 8(1): 1212.

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